Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO3Q9Y5L0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNPO3Q9Y5L0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNPO3Q9Y5L0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms