Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
RAPGEF2Q9Y4G8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
RAPGEF2Q9Y4G8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
RAPGEF2Q9Y4G8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
RAPGEF2Q9Y4G8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC40.9■■■■■ 4.14
RAPGEF2Q9Y4G8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
RAPGEF2Q9Y4G8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
RAPGEF2Q9Y4G8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
RAPGEF2Q9Y4G8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
RAPGEF2Q9Y4G8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
RAPGEF2Q9Y4G8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC40.86■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC40.85■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC40.84■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
RAPGEF2Q9Y4G8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
RAPGEF2Q9Y4G8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
RAPGEF2Q9Y4G8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
RAPGEF2Q9Y4G8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
RAPGEF2Q9Y4G8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
RAPGEF2Q9Y4G8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
RAPGEF2Q9Y4G8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
RAPGEF2Q9Y4G8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
RAPGEF2Q9Y4G8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
RAPGEF2Q9Y4G8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
RAPGEF2Q9Y4G8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
RAPGEF2Q9Y4G8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
RAPGEF2Q9Y4G8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
RAPGEF2Q9Y4G8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
RAPGEF2Q9Y4G8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
RAPGEF2Q9Y4G8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
RAPGEF2Q9Y4G8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
RAPGEF2Q9Y4G8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
RAPGEF2Q9Y4G8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
RAPGEF2Q9Y4G8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
RAPGEF2Q9Y4G8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
RAPGEF2Q9Y4G8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
RAPGEF2Q9Y4G8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
RAPGEF2Q9Y4G8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
RAPGEF2Q9Y4G8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
RAPGEF2Q9Y4G8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
RAPGEF2Q9Y4G8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC40.71■■■■■ 4.11
RAPGEF2Q9Y4G8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
RAPGEF2Q9Y4G8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
RAPGEF2Q9Y4G8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
RAPGEF2Q9Y4G8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
RAPGEF2Q9Y4G8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.68■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.68■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC40.66■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC40.63■■■■■ 4.1
RAPGEF2Q9Y4G8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
RAPGEF2Q9Y4G8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
RAPGEF2Q9Y4G8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
RAPGEF2Q9Y4G8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
RAPGEF2Q9Y4G8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
RAPGEF2Q9Y4G8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
RAPGEF2Q9Y4G8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
RAPGEF2Q9Y4G8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
RAPGEF2Q9Y4G8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
RAPGEF2Q9Y4G8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.1 ms