Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
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