Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
REXO2Q9Y3B8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
REXO2Q9Y3B8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
REXO2Q9Y3B8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
REXO2Q9Y3B8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
REXO2Q9Y3B8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
REXO2Q9Y3B8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
REXO2Q9Y3B8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
REXO2Q9Y3B8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
REXO2Q9Y3B8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
REXO2Q9Y3B8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
REXO2Q9Y3B8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
REXO2Q9Y3B8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
REXO2Q9Y3B8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
REXO2Q9Y3B8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
REXO2Q9Y3B8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
REXO2Q9Y3B8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
REXO2Q9Y3B8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
REXO2Q9Y3B8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
REXO2Q9Y3B8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
REXO2Q9Y3B8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
REXO2Q9Y3B8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
REXO2Q9Y3B8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
REXO2Q9Y3B8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms