Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B2

EXOSC1, Exosome complex component CSL4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC1Q9Y3B2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC1Q9Y3B2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC1Q9Y3B2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC1Q9Y3B2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC1Q9Y3B2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC1Q9Y3B2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC1Q9Y3B2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC1Q9Y3B2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC1Q9Y3B2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC1Q9Y3B2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC1Q9Y3B2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC1Q9Y3B2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC1Q9Y3B2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC1Q9Y3B2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.9 ms