Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT52Q9Y366 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT52Q9Y366 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT52Q9Y366 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms