Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V0

C15orf41, Uncharacterized protein C15orf41, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf41Q9Y2V0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C15orf41Q9Y2V0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C15orf41Q9Y2V0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C15orf41Q9Y2V0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf41Q9Y2V0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms