Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y277

VDAC3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC3Q9Y277 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VDAC3Q9Y277 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VDAC3Q9Y277 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VDAC3Q9Y277 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms