Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIPT1Q9Y234 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIPT1Q9Y234 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIPT1Q9Y234 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIPT1Q9Y234 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIPT1Q9Y234 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIPT1Q9Y234 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIPT1Q9Y234 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIPT1Q9Y234 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIPT1Q9Y234 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIPT1Q9Y234 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LIPT1Q9Y234 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIPT1Q9Y234 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIPT1Q9Y234 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIPT1Q9Y234 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIPT1Q9Y234 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIPT1Q9Y234 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIPT1Q9Y234 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIPT1Q9Y234 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIPT1Q9Y234 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms