Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNNQ9UQP3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNNQ9UQP3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TNNQ9UQP3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNNQ9UQP3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNNQ9UQP3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TNNQ9UQP3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNNQ9UQP3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNNQ9UQP3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNNQ9UQP3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNNQ9UQP3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNNQ9UQP3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNNQ9UQP3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TNNQ9UQP3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TNNQ9UQP3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TNNQ9UQP3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TNNQ9UQP3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNNQ9UQP3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNNQ9UQP3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNNQ9UQP3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNNQ9UQP3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNNQ9UQP3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNNQ9UQP3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNNQ9UQP3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNNQ9UQP3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
TNNQ9UQP3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TNNQ9UQP3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TNNQ9UQP3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNNQ9UQP3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNNQ9UQP3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNNQ9UQP3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNNQ9UQP3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNNQ9UQP3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNNQ9UQP3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNNQ9UQP3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNNQ9UQP3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNNQ9UQP3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNNQ9UQP3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TNNQ9UQP3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TNNQ9UQP3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TNNQ9UQP3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TNNQ9UQP3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TNNQ9UQP3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TNNQ9UQP3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TNNQ9UQP3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TNNQ9UQP3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TNNQ9UQP3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TNNQ9UQP3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TNNQ9UQP3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TNNQ9UQP3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TNNQ9UQP3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TNNQ9UQP3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TNNQ9UQP3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms