Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN8AQ9UQD0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN8AQ9UQD0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms