Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ53

MGAT4B, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase B, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4BQ9UQ53 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT4BQ9UQ53 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT4BQ9UQ53 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT4BQ9UQ53 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT4BQ9UQ53 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGAT4BQ9UQ53 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGAT4BQ9UQ53 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGAT4BQ9UQ53 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGAT4BQ9UQ53 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGAT4BQ9UQ53 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT4BQ9UQ53 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT4BQ9UQ53 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT4BQ9UQ53 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT4BQ9UQ53 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT4BQ9UQ53 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT4BQ9UQ53 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGAT4BQ9UQ53 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGAT4BQ9UQ53 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MGAT4BQ9UQ53 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGAT4BQ9UQ53 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGAT4BQ9UQ53 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MGAT4BQ9UQ53 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGAT4BQ9UQ53 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MGAT4BQ9UQ53 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms