Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHOC2Q9UQ13 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHOC2Q9UQ13 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHOC2Q9UQ13 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHOC2Q9UQ13 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SHOC2Q9UQ13 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHOC2Q9UQ13 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHOC2Q9UQ13 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHOC2Q9UQ13 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHOC2Q9UQ13 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHOC2Q9UQ13 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHOC2Q9UQ13 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHOC2Q9UQ13 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SHOC2Q9UQ13 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHOC2Q9UQ13 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHOC2Q9UQ13 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SHOC2Q9UQ13 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHOC2Q9UQ13 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHOC2Q9UQ13 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHOC2Q9UQ13 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHOC2Q9UQ13 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
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