Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MAPRE3Q9UPY8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAPRE3Q9UPY8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms