Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMG5Q9UPR3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMG5Q9UPR3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SMG5Q9UPR3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms