Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms