Protein–RNA interactions for Protein: Q9UND3

NPIPA1, Nuclear pore complex-interacting protein family member A1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA1Q9UND3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NPIPA1Q9UND3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NPIPA1Q9UND3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms