Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAPN11Q9UMQ6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN11Q9UMQ6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN11Q9UMQ6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN11Q9UMQ6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN11Q9UMQ6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN11Q9UMQ6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN11Q9UMQ6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN11Q9UMQ6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN11Q9UMQ6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN11Q9UMQ6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN11Q9UMQ6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN11Q9UMQ6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN11Q9UMQ6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN11Q9UMQ6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms