Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PADI3Q9ULW8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PADI3Q9ULW8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PADI3Q9ULW8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PADI3Q9ULW8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PADI3Q9ULW8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PADI3Q9ULW8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PADI3Q9ULW8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PADI3Q9ULW8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms