Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ0

STRIP2, Striatin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP2Q9ULQ0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRIP2Q9ULQ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRIP2Q9ULQ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRIP2Q9ULQ0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRIP2Q9ULQ0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRIP2Q9ULQ0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRIP2Q9ULQ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRIP2Q9ULQ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRIP2Q9ULQ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRIP2Q9ULQ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRIP2Q9ULQ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRIP2Q9ULQ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRIP2Q9ULQ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRIP2Q9ULQ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRIP2Q9ULQ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRIP2Q9ULQ0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRIP2Q9ULQ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRIP2Q9ULQ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRIP2Q9ULQ0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRIP2Q9ULQ0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRIP2Q9ULQ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRIP2Q9ULQ0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRIP2Q9ULQ0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRIP2Q9ULQ0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRIP2Q9ULQ0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRIP2Q9ULQ0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRIP2Q9ULQ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
STRIP2Q9ULQ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRIP2Q9ULQ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRIP2Q9ULQ0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRIP2Q9ULQ0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRIP2Q9ULQ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRIP2Q9ULQ0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms