Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO4Q9UKT5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO4Q9UKT5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO4Q9UKT5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO4Q9UKT5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO4Q9UKT5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO4Q9UKT5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO4Q9UKT5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO4Q9UKT5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO4Q9UKT5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO4Q9UKT5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO4Q9UKT5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO4Q9UKT5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO4Q9UKT5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO4Q9UKT5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO4Q9UKT5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO4Q9UKT5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO4Q9UKT5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO4Q9UKT5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FBXO4Q9UKT5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms