Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CROTQ9UKG9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CROTQ9UKG9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms