Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL4Q9UJQ4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL4Q9UJQ4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SALL4Q9UJQ4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms