Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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