Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLCO3A1Q9UIG8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLCO3A1Q9UIG8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLCO3A1Q9UIG8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLCO3A1Q9UIG8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLCO3A1Q9UIG8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLCO3A1Q9UIG8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO3A1Q9UIG8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO3A1Q9UIG8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO3A1Q9UIG8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO3A1Q9UIG8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO3A1Q9UIG8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO3A1Q9UIG8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO3A1Q9UIG8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLCO3A1Q9UIG8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLCO3A1Q9UIG8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms