Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI43

MRM2, rRNA methyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRM2Q9UI43 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRM2Q9UI43 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRM2Q9UI43 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRM2Q9UI43 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms