Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SWAP70Q9UH65 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SWAP70Q9UH65 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms