Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF12

PRODH2, Hydroxyproline dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODH2Q9UF12 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRODH2Q9UF12 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRODH2Q9UF12 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms