Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
POLKQ9UBT6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
POLKQ9UBT6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
POLKQ9UBT6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
POLKQ9UBT6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
POLKQ9UBT6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
POLKQ9UBT6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
POLKQ9UBT6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
POLKQ9UBT6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
POLKQ9UBT6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
POLKQ9UBT6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
POLKQ9UBT6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
POLKQ9UBT6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
POLKQ9UBT6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLKQ9UBT6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLKQ9UBT6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLKQ9UBT6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLKQ9UBT6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLKQ9UBT6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLKQ9UBT6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
POLKQ9UBT6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLKQ9UBT6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLKQ9UBT6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
POLKQ9UBT6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLKQ9UBT6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLKQ9UBT6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLKQ9UBT6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
POLKQ9UBT6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
POLKQ9UBT6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
POLKQ9UBT6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
POLKQ9UBT6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
POLKQ9UBT6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
POLKQ9UBT6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
POLKQ9UBT6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
POLKQ9UBT6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
POLKQ9UBT6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
POLKQ9UBT6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
POLKQ9UBT6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
POLKQ9UBT6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
POLKQ9UBT6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
POLKQ9UBT6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
POLKQ9UBT6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
POLKQ9UBT6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
POLKQ9UBT6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
POLKQ9UBT6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
POLKQ9UBT6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
POLKQ9UBT6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
POLKQ9UBT6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
POLKQ9UBT6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
POLKQ9UBT6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
POLKQ9UBT6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
POLKQ9UBT6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
POLKQ9UBT6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
POLKQ9UBT6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
POLKQ9UBT6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
POLKQ9UBT6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
POLKQ9UBT6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
POLKQ9UBT6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
POLKQ9UBT6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
POLKQ9UBT6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
POLKQ9UBT6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
POLKQ9UBT6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
POLKQ9UBT6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
POLKQ9UBT6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
POLKQ9UBT6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
POLKQ9UBT6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
POLKQ9UBT6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms