Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
PSMC3IPQ9P2W1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMC3IPQ9P2W1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms