Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
LRP2BPQ9P2M1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.82■■■□□ 2.37
LRP2BPQ9P2M1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms