Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
RRBP1Q9P2E9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
RRBP1Q9P2E9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.66
RRBP1Q9P2E9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RRBP1Q9P2E9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
RRBP1Q9P2E9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
RRBP1Q9P2E9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
RRBP1Q9P2E9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
RRBP1Q9P2E9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RRBP1Q9P2E9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RRBP1Q9P2E9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RRBP1Q9P2E9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RRBP1Q9P2E9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RRBP1Q9P2E9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RRBP1Q9P2E9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RRBP1Q9P2E9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
RRBP1Q9P2E9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
RRBP1Q9P2E9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
RRBP1Q9P2E9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RRBP1Q9P2E9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
RRBP1Q9P2E9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
RRBP1Q9P2E9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RRBP1Q9P2E9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
RRBP1Q9P2E9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RRBP1Q9P2E9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
RRBP1Q9P2E9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RRBP1Q9P2E9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RRBP1Q9P2E9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
RRBP1Q9P2E9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
RRBP1Q9P2E9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RRBP1Q9P2E9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RRBP1Q9P2E9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
RRBP1Q9P2E9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms