Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
HMG20BQ9P0W2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HMG20BQ9P0W2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HMG20BQ9P0W2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HMG20BQ9P0W2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HMG20BQ9P0W2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HMG20BQ9P0W2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HMG20BQ9P0W2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HMG20BQ9P0W2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HMG20BQ9P0W2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HMG20BQ9P0W2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HMG20BQ9P0W2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HMG20BQ9P0W2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HMG20BQ9P0W2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HMG20BQ9P0W2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HMG20BQ9P0W2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HMG20BQ9P0W2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms