Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMOD2Q9NZR1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMOD2Q9NZR1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMOD2Q9NZR1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMOD2Q9NZR1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMOD2Q9NZR1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD2Q9NZR1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD2Q9NZR1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD2Q9NZR1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD2Q9NZR1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD2Q9NZR1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD2Q9NZR1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMOD2Q9NZR1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMOD2Q9NZR1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMOD2Q9NZR1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMOD2Q9NZR1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMOD2Q9NZR1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMOD2Q9NZR1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMOD2Q9NZR1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMOD2Q9NZR1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms