Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN8

CNOT2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2Q9NZN8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT2Q9NZN8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT2Q9NZN8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms