Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM3

ITSN2, Intersectin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN2Q9NZM3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
ITSN2Q9NZM3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ITSN2Q9NZM3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ITSN2Q9NZM3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
ITSN2Q9NZM3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.71
ITSN2Q9NZM3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ITSN2Q9NZM3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ITSN2Q9NZM3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ITSN2Q9NZM3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ITSN2Q9NZM3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ITSN2Q9NZM3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ITSN2Q9NZM3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ITSN2Q9NZM3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ITSN2Q9NZM3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ITSN2Q9NZM3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ITSN2Q9NZM3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ITSN2Q9NZM3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ITSN2Q9NZM3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ITSN2Q9NZM3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ITSN2Q9NZM3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ITSN2Q9NZM3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ITSN2Q9NZM3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ITSN2Q9NZM3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
ITSN2Q9NZM3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ITSN2Q9NZM3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ITSN2Q9NZM3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ITSN2Q9NZM3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ITSN2Q9NZM3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ITSN2Q9NZM3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ITSN2Q9NZM3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ITSN2Q9NZM3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
ITSN2Q9NZM3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
ITSN2Q9NZM3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
ITSN2Q9NZM3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
ITSN2Q9NZM3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
ITSN2Q9NZM3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ITSN2Q9NZM3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ITSN2Q9NZM3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
ITSN2Q9NZM3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ITSN2Q9NZM3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ITSN2Q9NZM3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ITSN2Q9NZM3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
ITSN2Q9NZM3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
ITSN2Q9NZM3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ITSN2Q9NZM3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ITSN2Q9NZM3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ITSN2Q9NZM3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ITSN2Q9NZM3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ITSN2Q9NZM3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ITSN2Q9NZM3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ITSN2Q9NZM3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ITSN2Q9NZM3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ITSN2Q9NZM3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ITSN2Q9NZM3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.69
ITSN2Q9NZM3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
ITSN2Q9NZM3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
ITSN2Q9NZM3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
ITSN2Q9NZM3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
ITSN2Q9NZM3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ITSN2Q9NZM3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
ITSN2Q9NZM3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ITSN2Q9NZM3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
ITSN2Q9NZM3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ITSN2Q9NZM3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ITSN2Q9NZM3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
ITSN2Q9NZM3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ITSN2Q9NZM3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ITSN2Q9NZM3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ITSN2Q9NZM3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ITSN2Q9NZM3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.66
ITSN2Q9NZM3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
ITSN2Q9NZM3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ITSN2Q9NZM3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
ITSN2Q9NZM3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ITSN2Q9NZM3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms