Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZDHHC3Q9NYG2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZDHHC3Q9NYG2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms