Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CMTM6Q9NX76 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CMTM6Q9NX76 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMTM6Q9NX76 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms