Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWS1

PARPBP, PCNA-interacting partner, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARPBPQ9NWS1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARPBPQ9NWS1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARPBPQ9NWS1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PARPBPQ9NWS1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARPBPQ9NWS1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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