Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 FANCA-218ENST00000565582 812 ntTSL 312.31□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 FANCA-230ENST00000568369 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 27.1
SLTMQ9NWH9 KCNAB2-208ENST00000389632 959 ntTSL 515□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 27.1
SLTMQ9NWH9 KCNAB2-210ENST00000435937 500 ntTSL 314.69□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 27.1
SLTMQ9NWH9 KCNAB2-209ENST00000428161 961 ntTSL 214.3□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 27.1
SLTMQ9NWH9 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 27.1
SLTMQ9NWH9 KCNAB2-201ENST00000164247 4273 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 27.1
SLTMQ9NWH9 KCNAB2-203ENST00000352527 4165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 27.1
SLTMQ9NWH9 PIGZ-201ENST00000238138 868 ntTSL 226.98■■□□□ 1.913e-7■■■■■ 27.1
SLTMQ9NWH9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.673e-7■■■■■ 27.1
SLTMQ9NWH9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 27.1
SLTMQ9NWH9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.092e-6■■■■■ 27.1
SLTMQ9NWH9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 27.1
SLTMQ9NWH9 INPP5A-201ENST00000342652 832 ntTSL 510.48□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 27.1
SLTMQ9NWH9 INPP5A-204ENST00000423490 416 ntTSL 56.08□□□□□ -1.448e-7■■■■■ 27.1
SLTMQ9NWH9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.025e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.645e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 NFATC1-213ENST00000590313 1919 ntTSL 218.84■□□□□ 0.615e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.525e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.225e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.025e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.15e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.145e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.265e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 STIP1-208ENST00000540501 880 ntTSL 326.77■■□□□ 1.881e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.71e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 MIRLET7BHG-204ENST00000443490 494 ntTSL 521.65■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 KAZN-206ENST00000491547 5592 ntTSL 221.3■■□□□ 11e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.981e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 MIRLET7BHG-202ENST00000381051 875 ntTSL 220.3■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 PEX26-204ENST00000474897 2082 ntTSL 519.8■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 STIP1-204ENST00000536973 738 ntTSL 513.6□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 STIP1-211ENST00000543847 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 SMPD4P1-203ENST00000443839 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 STIP1-209ENST00000540736 399 ntTSL 25.74□□□□□ -1.491e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 FAM35A-203ENST00000437629 969 ntTSL 324.9■■□□□ 1.583e-9■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.116e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 GGT1-210ENST00000412658 2091 ntTSL 518.21■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 GGT1-212ENST00000419133 1078 ntTSL 517.88■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 GGT1-222ENST00000455483 579 ntTSL 516.89■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 SNRPD3-204ENST00000439775 640 ntTSL 316.86■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 GGT1-211ENST00000412898 831 ntTSL 515.63■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 GGT1-223ENST00000456869 597 ntTSL 315.63■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 GGT1-218ENST00000445029 606 ntTSL 315.43■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 GGT1-221ENST00000452551 811 ntTSL 314.91□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC14.38□□□□□ -0.116e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.143e-9■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 GGT1-217ENST00000438643 537 ntTSL 1 (best)13.82□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 GGT1-215ENST00000430289 929 ntTSL 513.75□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 GGT1-209ENST00000411974 758 ntTSL 313.63□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 SNRPD3-203ENST00000404603 715 ntTSL 58.74□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.463e-9■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.683e-9■■■■■ 27
SLTMQ9NWH9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.332e-7■■■■■ 26.9
SLTMQ9NWH9 ARL6IP4-217ENST00000540382 1677 ntTSL 526.48■■□□□ 1.831e-6■■■■■ 26.9
SLTMQ9NWH9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.81e-6■■■■■ 26.9
SLTMQ9NWH9 ARL6IP4-218ENST00000540708 1782 ntTSL 226.14■■□□□ 1.781e-6■■■■■ 26.9
SLTMQ9NWH9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.671e-6■■■■■ 26.9
SLTMQ9NWH9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.431e-6■■■■■ 26.9
SLTMQ9NWH9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.321e-6■■■■■ 26.9
SLTMQ9NWH9 ARL6IP4-216ENST00000539770 1295 ntTSL 1 (best)23.1■■□□□ 1.291e-6■■■■■ 26.9
SLTMQ9NWH9 ARL6IP4-209ENST00000442210 716 ntTSL 322.67■■□□□ 1.221e-6■■■■■ 26.9
SLTMQ9NWH9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 26.9
SLTMQ9NWH9 ARL6IP4-214ENST00000536502 1273 ntTSL 221.98■■□□□ 1.111e-6■■■■■ 26.9
SLTMQ9NWH9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 26.9
SLTMQ9NWH9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 26.9
SLTMQ9NWH9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 26.9
SLTMQ9NWH9 ARL6IP4-215ENST00000539576 1684 ntTSL 520.49■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 26.9
SLTMQ9NWH9 ARL6IP4-203ENST00000392433 1370 ntTSL 219.24■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 26.9
SLTMQ9NWH9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 26.9
SLTMQ9NWH9 ARL6IP4-206ENST00000413381 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.76□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 26.9
SLTMQ9NWH9 TRAPPC12-211ENST00000452495 544 ntTSL 415.17■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 26.9
SLTMQ9NWH9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.751e-6■■■■■ 26.8
SLTMQ9NWH9 KCTD15-204ENST00000587658 632 ntTSL 324.93■■□□□ 1.581e-6■■■■■ 26.8
SLTMQ9NWH9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.451e-6■■■■■ 26.8
SLTMQ9NWH9 PTPRG-205ENST00000475527 2694 ntTSL 521.71■■□□□ 1.073e-7■■■■■ 26.8
SLTMQ9NWH9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.973e-7■■■■■ 26.8
SLTMQ9NWH9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.893e-7■■■■■ 26.8
SLTMQ9NWH9 MNX1-208ENST00000605400 1753 nt20.14■□□□□ 0.813e-7■■■■■ 26.8
SLTMQ9NWH9 PTPRG-207ENST00000495879 3011 ntTSL 1 (best)19.99■□□□□ 0.793e-7■■■■■ 26.8
SLTMQ9NWH9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.713e-7■■■■■ 26.8
SLTMQ9NWH9 THOP1-208ENST00000587468 671 ntTSL 219.34■□□□□ 0.693e-7■■■■■ 26.8
SLTMQ9NWH9 THOP1-209ENST00000589087 2977 ntTSL 219.12■□□□□ 0.653e-7■■■■■ 26.8
SLTMQ9NWH9 THOP1-211ENST00000590970 1104 ntTSL 318.58■□□□□ 0.563e-7■■■■■ 26.8
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