Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWA0

MED9, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED9Q9NWA0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED9Q9NWA0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED9Q9NWA0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MED9Q9NWA0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED9Q9NWA0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED9Q9NWA0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms