Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
FBXO28Q9NVF7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO28Q9NVF7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FBXO28Q9NVF7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FBXO28Q9NVF7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO28Q9NVF7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO28Q9NVF7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO28Q9NVF7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO28Q9NVF7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO28Q9NVF7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO28Q9NVF7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO28Q9NVF7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO28Q9NVF7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FBXO28Q9NVF7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FBXO28Q9NVF7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FBXO28Q9NVF7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FBXO28Q9NVF7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms