Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC39A9Q9NUM3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC39A9Q9NUM3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.1 ms