Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TREX1Q9NSU2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TREX1Q9NSU2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms