Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNTG1Q9NSN8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNTG1Q9NSN8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms