Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FARSBQ9NSD9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FARSBQ9NSD9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FARSBQ9NSD9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FARSBQ9NSD9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FARSBQ9NSD9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FARSBQ9NSD9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FARSBQ9NSD9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FARSBQ9NSD9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FARSBQ9NSD9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FARSBQ9NSD9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARSBQ9NSD9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms