Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
THSD1Q9NS62 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
THSD1Q9NS62 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THSD1Q9NS62 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THSD1Q9NS62 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THSD1Q9NS62 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THSD1Q9NS62 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms