Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PHPT1Q9NRX4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHPT1Q9NRX4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHPT1Q9NRX4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms