Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS45Q9NRW7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS45Q9NRW7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms