Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLE3Q9NRF9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLE3Q9NRF9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLE3Q9NRF9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms